GoogleサイトにjQuery本体をアップロードしたところで、html編集しても有効にならなかった。
じゃあxmlでガジェット化してやったらどうだろうって思ったらこれでうまくいった。
<Module>
<!-- ガジェット名 -->
<ModulePrefs title="myapp" />
<Content type="html">
<![CDATA[
[htmlのhead部分を羅列]
[htmlのbody部分を羅列]
]]>
</Content>
</Module>
xmlファイルを作成したら、各ページ内にガジェットとして埋め込む。